Есть доказательства того, что растения перца устойчивы к засухе, плодоношение, как правило, снижается при любых экстремальных условиях окружающей среды. Известно, что перец чувствителен к стрессу от влаги во время цветения и завязывания плодов. Если во время цветения рост растений замедляется из-за дефицита влаги, то цветки и незрелые стручки могут опасть. Концевая гниль цветков может возникнуть, если растения испытывают стресс во время быстрого развития молодых плодов.

Ограничение полива перца в период быстрого вегетативного роста также снижает конечный урожай. Растения, испытывающие недостаток воды, не только обычно дают относительно низкий урожай стручков, но их стручки также имеют меньший размер и более жгучий вкус, чем те, которые были получены при достаточной влажности почвы.